Самые многочисленные биологические объекты на Земле, безусловно, вирусы. Те, что уже известны человеку, представляют собой лишь вершину айсберга. Британским ученым удалось идентифицировать более 140 тысяч видов вирусов, обитающих в кишечнике, более половины из них ранее не были открыты.
Исследователи из Института Wellcome Sanger и Европейского института биоинформатики EMBL проанализировали десятки тысяч образцов кишечного микробиома из разных стран. Используя метод секвенирования ДНК, называемый метагеномикой, ученые изучили и каталогизировали биоразнообразие видов вирусов, обнаруженных в 28 060 общедоступных метагеномах кишечника человека и 2 898 геномах бактериальных изолятов, культивируемых из человеческого кишечника.
Вирусы, населяющие кишечник, называют бактериофагами, так как они способны инфицировать бактерии. До сих пор мало известно о той роли, которую кишечные бактерии и бактериофаги играют в болезнях человека. Полученные в ходе исследования данные открывают новые возможности для изучения того, как вирусы, живущие в кишечнике, связаны со здоровьем.
Александр Алмейда, научный сотрудник Института Wellcome Sanger:
Важно помнить, что не все вирусы вредны, они представляют собой неотъемлемый компонент экосистемы кишечника.
Во-первых, большинство обнаруженных нами вирусов имеют ДНК, что отличает их от патогенов, таких как SARS-CoV-2 или вирус Зика, которые являются РНК-вирусами.
Во-вторых, эти образцы получены в основном от здоровых людей, не имеющих каких-либо конкретных заболеваний. Удивительно, как много неизвестных видов обитает в нашем кишечнике, и очень интересно пытаться выяснить связь между ними и здоровьем человека.
Результаты исследования составят основу для базы данных кишечных фагов (GPD), содержащей 142 809 неизбыточных геномов фагов, которые станут бесценным ресурсом для тех, кто изучает бактериофаги и их роль в регулировании здоровья.