В соответствии с Указом Президента Республики Беларусь Александра Лукашенко «О совершенствовании стимулирования творческого труда молодых ученых» талантливым молодым ученым назначены стипендии на 2026 год. Среди стипендиатов — Павел Бобрик, младший научный сотрудник РНПЦ детской онкологии, гематологии и иммунологии. Разработанный им биоинформатический алгоритм дает возможность автоматизированного выявления и интерпретации генетических вариантов, ассоциированных с первичными иммунодефицитами, улучшает диагностику и результаты лечения. Практическая значимость разработки подтверждена 4 рационализаторскими предложениями, инструкцией по применению, утвержденной Минздравом, 9 актами о внедрении в лечебную практику учреждений здравоохранения.
В 4-м классе решил стать биологом…
Павел Бобрик родом из Молодечно, родился и вырос в обычной семье: мама, папа, двое детей. С детства любил природу, замечал ее красоту, нравилось изучать природные явления, искать закономерности. В семейном архиве сохранилось школьное видео, где у выпускников 4-го класса брали интервью на тему будущей профессии. Павел тогда уверенно заявил, что будет биологом, хотя такой предмет в 4-м классе еще не изучали. В 2018 году стал студентом биологического факультета БГУ по специальности «Биология (научно-педагогическая деятельность)».
…а в университете увлекся генетикой и цифровыми технологиями
— Во время обучения в университете меня особенно привлекали молекулярная биология и генетика, — рассказывает Павел Бобрик. — На современном этапе развития науки эти направления неразрывно связаны с цифровыми технологиями, моделированием, обработкой больших объемов данных. На многих дисциплинах у нас присутствовали элементы информатики, т. е. обучение и работа с некоторыми программами. Было желание развивать свои навыки в компьютерных технологиях, поэтому много занимался самообразованием.
На выпускном курсе еще до распределения Павел узнал, что в одном из ведущих научно-практических центров, РНПЦ ДОГИ, ищут специалиста по анализу данных. Будущий биолог на тот момент обладал такими навыками и решил откликнуться на вакансию. Предстояло пройти серьезную конкуренцию с дипломированными программистами, однако они не имели знаний в биологии. Тогда (в начале 2022 года) в нашей стране не было такой специальности, как биоинформатика, этих специалистов стали готовить чуть позже. Вот так получилось, что еще в самом начале своего профессионального пути Павел Бобрик сумел немножко опередить время.
— В центре выполняется много молекулярно-генетических исследований, в том числе с использованием технологии высокопроизводительного секвенирования, — рассказывает Павел Бобрик. — Упрощенно говоря, секвенирование — это процесс прочтения ДНК прибором, секвенатором, позволяющим выявлять разнообразные генетические варианты, которые могут быть причиной заболевания. Полученные данные о ДНК пациента выравниваются в референсную последовательность и сравниваются с эталонной, чтобы затем выявить отклонения в виде нуклеотидных замен. Их может быть огромное множество. В ходе первичной биоинформатической обработки формируется файл с тысячами нуклеотидных замен, такой анализ вручную невозможен, нужна вычислительная техника, специальные программы. Мне предложили тестовое задание — самостоятельно выполнить первичную обработку данных ДНК-пациента — от сырых до предфинальных, то есть вывести предфинальный файл с нуля до примерно тысячи нуклеотидных замен. На тот момент у меня был ноутбук с операционной системой Windows, а для такого анализа нужна Linux, установил ее…
Задание было успешно выполнено. Выпускник БГУ, профессиональный биолог с прикладными знаниями анализа данных был принят младшим научным сотрудником в лабораторию молекулярно-генетических исследований РНПЦ ДОГИ.
К слову, «Медицинский вестник» в августе 2022 года писал о мероприятии, где чествовали молодых специалистов, пришедших в РНПЦ. Павел Бобрик тогда увлеченно рассказывал, что будет заниматься биоаналитикой — высокотехнологичным направлением на стыке биологии и информатики.
— Я рад, что в начале своего пути встретил компетентных людей, способствующих моему профессиональному росту как научного сотрудника. Об этом хочется сказать отдельно, выразить благодарность директору центра Анжелике Викторовне Солнцевой, заместителю директора по науке Михаилу Владимировичу Белевцеву, сотрудникам и руководителю нашей лаборатории Ирине Евгеньевне Гурьяновой. Поддержка чувствовалась на всех уровнях, сразу был решен вопрос с комнатой в общежитии, — отмечает Павел Бобрик.
К слову, совсем недавно благодаря ходатайству директора центра молодой ученый переехал в новую арендную квартиру в ЖК «Магистр», где выделяют жилье для работников науки и культуры.
Начинал с первичного биоинформатического анализа…
В РНПЦ ДОГИ выполняются все виды высокопроизводительного секвенирования — таргетное, полноэкзомное, полногеномное.
— Первое время я занимался в основном только первичной биоинформатической обработкой — от сырых файлов до WCF-файлов, — вспоминает Павел. — Постепенно подключился к интерпретации данных. Из файла с тысячами нуклеотидных замен нужно выделить только клинически значимые в соответствии с фенотипом пациента, его клиническими характеристиками. Финальная обработка таких данных и написание итогового заключения — работа интерпретатора NGS.
Обычно именно на эту задачу требуется больше всего времени даже с наличием мощной вычислительной техники — недели и месяцы. Павел Юрьевич признается, что сразу озадачился вопросом: можно ли автоматизировать и ускорить этот процесс?
…и создал алгоритм автоматизированной интерпретации данных
Занимаясь биоинформационным анализом и финальной обработкой данных, полученных при секвенировании, молодой специалист постоянно отслеживал и изучал мировые тенденции, совершенствовал языки программирования. Итогом этих усилий стало создание биоинформатического алгоритма автоматизированного выявления и интерпретации генетических вариантов. Применение алгоритма позволяет сократить процесс диагностики с нескольких месяцев до нескольких часов!
Суть разработки в том, что в программу загружаются самые первые, сырые файлы, выбираются параметры фильтрации, обрабатываются в течение какого-то времени. Результат выдается в виде итогового заключения, содержащего клинически значимые варианты. Это серьезно экономит время, дает врачу возможность для определения конкретного диагноза. Врач соотносит клиническую картину пациента с информацией об изменениях, выявленных в определенных генах.
В основном упор сделан на первичные иммунодефициты, потому что это одно из генетически детерминирован-ных заболеваний, особенно сложных в диагностике.
Именно эта разработка Павла Бобрика отмечена Президентской стипендией.
— Продолжаю совершенствовать созданный алгоритм, — уточняет автор. — Например, в группе первичных иммунодефицитов каждый год выявляется несколько новых генетических вариантов, обусловливающих болезнь. Включаю их в алгоритм фильтрации. Кроме того, в нашем центре применяем этот веб-инструмент на генетической модели по наследственной онкологии. Для соматической не подходит, там нужны другие алгоритмы.
Большая ценность созданного Павлом Бобриком веб-инструмента в том, что его можно применять в любой лаборатории, выполняющей высокопроизводительное секвенирование при диагностике наследственных заболеваний.
— Сейчас думаем, в какой форме можно эту идею реализовать: либо как веб-ресурс, чтобы к нам могли подключаться, но тогда нужно серьезно усилить защиту данных, либо будем предоставлять код, чтобы в других организациях запускали программу локально, — отмечает молодой ученый.
За прошедшие три с половиной года своего профессионального пути Павел Бобрик сумел ярко проявить себя, является соавтором опубликованных научных статей. В 2024-м вошел в число призеров Республиканского конкурса стартап-проектов в сфере здравоохранения MedicalStartup за разработку веб-инструмента для обработки данных бисульфидного секвенирования при тестикулярных герминогенных опухолях. В июне 2025 года признан победителем областного конкурса «Молодой лидер Минщины» в сфере научной деятельности. В ноябре представил Беларусь на международной конференции «Молекулярная диагностика — 2025», выступил с докладом на секции «Новейшие разработки в области массового параллельного секвенирования (NGS)».
Анжелика Солнцева, директор РНПЦ ДОГИ:
Для того чтобы стать частью коллектива нашего центра, перспективные выпускники вузов проходят строгий отбор, а в дальнейшем мы делаем все, чтобы раскрыть заложенный в них потенциал. Младший научный сотрудник Павел Бобрик, занимаясь биоинформационным анализом, проявляет себя не только как квалифицированный исполнитель, но и как генератор идей. За три года самостоятельно разработал несколько методов, связанных с анализом данных секвенирования нового поколения, эти разработки внедрены в нашем центре.
Пользуясь случаем, выражаю благодарность родителям Павла за то, что вырастили и воспитали такого замечательного сына. Он достаточно скромный, немногословный, при этом очень грамотный и компетентный в своем направлении. В моем понимании именно таким и должен быть настоящий молодой ученый!